Khoa đào tạo Sau đại học cung cấp 2 chương trình đào tạo chính: Thạc sĩ Quản trị Kinh doanh và Thạc sĩ Kế toán. Đây là các chương trình trọng tâm của trường Đại học Công nghệ Đông Á đáp ứng yêu cầu nâng cao chất lượng đào tạo thực tiễn dựa trên phương pháp giảng dạy hiện đại Harvard. Chương trình được xây dựng dựa trên Case Study bằng các tình huống thực tiễn trong doanh nghiệp. Với đội ngũ giảng viên là các chuyên gia hàng đầu nhiều năm cả kinh nghiệm giảng dạy và tư vấn thực chiến đảm bảo cho chương trình lõi chuyên sâu chất lượng. Không chỉ vậy nhằm nâng cao hiệu quả chương trình, khoa còn mời những chuyên gia kinh tế tài chính, CEO của các công ty tập đoàn đến trao đổi giúp học viên thêm nhiều trải nghiệm.